Kommissionen vill se mer konkurrens och menar att flygbolag och resenärer missgynnas av den nuvarande ägarstrukturen där ett bolag kontrollerar landets största flygplatser, skriver BBC.
Nära 90 procent av alla flygresor till och från London går via flygplatserna Heathrow, Gatwick och Stansted, som alla kontrolleras av BAA.
Kritiken mot BAA har växt under de senaste åren och klagomålen gäller främst dålig service och förseningar på flygplatserna - problem som kommissionen säger beror på att ägaren är en och densamma.
BAA svarar att problemen i stället beror på kapacitetsbegränsningar och att konkurrens på marknaden inte kan utvecklas så länge som flygplatserna inte tillåts växa, skriver BBC på onsdagen.